Toyotalle auton turvallisuus on ollut suunnittelussa ensisijaista. Tärkeät turvavarusteet kuuluvat jo vakiovarusteluun. Siksi uusi Yaris sai täydet viisi tähteä kuten kahdessa edellisessäkin testissä. Kaiken kaikkiaan vuoden 2017 autoista vain 15 sai täydet tähdet.
Euro NCAP testasi Toyota Yarisin turvallisuutta neljällä eri osa-alueilla. Toyota Yaris saavutti erinomaiset tulokset kaikilla mitatuilla osa-alueilla eli aikuismatkustajien suojasta, lapsimatkustajien suojasta, jalankulkijaturvallisuudesta sekä turvavarustelusta.
Toyota Yarisin menestyksen takana on erittäin vankka korirakenne sekä vakiovarusteena olevat Toyota Safety Sense -turvavarusteet. Ne auttavat kuljettajaa välttämään törmäyksiä tai minimoimaan niiden haittoja.
Yarisin Toyota Safety Sense sisältää Pre-Collision -törmäyksenestojärjestelmän, kaistavahdin, automaattiset kaukovalot sekä Active-varustetasosta alkaen liikennemerkkien tunnistusjärjestelmän.
Euro NCAP eli The European New Car Assessment Programme on puolueeton taho, joka testaa autojen turvallisuutta erilaisin testein. Autojen turvallisuutta kuvataan antamalla sille 0–5 tähteä.